空间生物学的智能解码、集成与生成5.20

时间:14:00 - 15:00


地点:数学高等研究院报告厅


组织者:阮勇斌,黄德力,印焘, 宋海,周家耀


报告人:张世华(中国科学院数学与系统科学研究院)

摘要:空间转录组学的技术进步对于更好地理解生物研究中组织的结构和功能至关重要。人工智能算法与空间转录组学的结合为破译组织结构提供了有效途径。我们团队开发了STA-系列空间转录组学AI工具,比如STAGATE和STAligner。最近,我们提出了空间多组学整合工具STAMO、定向或时变基因检测工具STAVAG,空间转录组学的高保真模拟和全视图3D建模工具STADiffuser,跨物种空间转录组集成工具STACAME,以及空间组学可扩展通用解析工具STAX。在这次报告中,我将以其中的典型算法和工具为例,介绍如何利用深度学习有效地建模空间转录组学数据,并用以解决生物学中的关键问题。